脑发育不良的病因有很多，既可发生于出生前，如各种原因所致的胚胎期脑发育异常等。也可发生在出生时，如新生儿窒息、产伤等，还可发生于出生后，如某些心肺功能异常疾病(先天性心脏病，呼吸窘迫症等)引起的脑损伤。以下几点也是导致脑发育不全的原因：

　　1、先天性因素：包括胚胎期脑发育畸形，先天性脑积水，母亲妊娠早期重症感染(特别是病毒感染)，严重营养缺乏，外伤，中毒(如妊娠毒血症)及放射线照射等，遗传因素在脑发育不全中的作用不明显。

　　2、其他因素：包括各种感染，外伤，中毒，颅内出血及重症窒息等，研究统计脑发育不良的高危因素包括母亲产前患癫痫，甲状腺功能亢进及毒血症等，妊娠末期3个月内出血事件，产期宫缩无力，胎盘早剥，前置胎盘及臀位产等也可诱发脑发育不全。

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